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function s = rod_wrfgetdata(ruta,dom,auxlat,auxlon,zlev)
% s = rod_wrfgetdata(ruta,dom)
% FunciÃn para extraer campos principales de WRF.
%
% & Inputs:
%
% ruta: ruta donde se encuentran los archivos wrfout.
% dom: NÃmero de dominio del cual se desea extraer el
% punto de grilla. Depende del nÃmero mÃximo
% de dominios que posea la simulaciÃn.
%
% & Outputs:
%
% s: estructura con los campos principales extraidos.
s.u = [];
s.v = [];
s.w = [];
s.p = [];
s.hg = [];
%s.qr = [];
s.tp = [];
%s.q2 = [];
s.t2 = [];
%s.qc = [];
s.u10 = [];
s.v10 = [];
s.psfc = [];
s.lat = [];
s.lon = [];
s.pre = [];
%s.qv = [];
%s.tke = [];
s.temp = [];
%s.hr = [];
s.topo = [];
%s.agua = [];
%s.tp_liq = [];
%s.alt_base = [];
%s.alt_tope = [];
%s.grosor = [];
%s.lh = [];
%s.sh = [];
s.tsk = [];
%s.sst = [];
%s.uast = [];
%s.el_pbl = [];
aux = sprintf([ruta '/wrfout_d%2.2d*00:00:00'],dom);
archivos = rod_lscell(aux);
cont = 0;
for i = 1:length(archivos)
disp(['Iterando para ' archivos{i}])
%% Extrae campos primarios de simulación:
% Extrae campos de latitud y longitud y busca posiciones auxiliares a
% extraer:
lat_dom = ncread(archivos{i},'XLAT'); % latitud dominio.
lon_dom = ncread(archivos{i},'XLONG'); % longitud dominio.
squeeze(lon_dom(:,1,1))
poslat = find(squeeze(lat_dom(1,:,1)) >= auxlat(1) & squeeze(lat_dom(1,:,1)) <= auxlat(2));
poslon = find(squeeze(lon_dom(:,1,1)) >= auxlon(1) & squeeze(lon_dom(:,1,1)) <= auxlon(2));
u_dom = ncread(archivos{i},'U'); % velocidad zonal.
v_dom = ncread(archivos{i},'V'); % velocidad meridional
w_dom = ncread(archivos{i},'W'); % velocidad vertical.
ph_dom = ncread(archivos{i},'PH'); % perturbación geopotencial.
phb_dom = ncread(archivos{i},'PHB'); % estado-base geopotencial.
t_dom = ncread(archivos{i},'T'); % perturbación de temperatura potencial.
p_dom = ncread(archivos{i},'P'); % perturbación de presión.
pb_dom = ncread(archivos{i},'PB'); % estado-base presión.
%q2 = ncread(archivos{i},'Q2'); % razón de mezcla a 2m.
t2 = ncread(archivos{i},'T2'); % temperatura a 2m.
psfc = ncread(archivos{i},'PSFC'); % presión superficial.
u10 = ncread(archivos{i},'U10'); % velocidad zonal a 10m.
v10 = ncread(archivos{i},'V10'); % velocidad meridional a 10m.
%qvapor = ncread(archivos{i},'QVAPOR'); % razón de mezcla de vapor.
% qcloud = ncread(archivos{i},'QCLOUD'); % razÃn de mezcla de nube.
% qrain = ncread(archivos{i},'QRAIN'); % razÃn de mezcla de lluvia.
% hgt_dom = ncread(archivos{i},'HGT'); % altura de terreno.
% rainc = ncread(archivos{i},'RAINC'); % lluvia convectiva.
% rainnc = ncread(archivos{i},'RAINNC'); % lluvia no convectiva.
topo_dom = ncread(archivos{i},'HGT'); % topografÃa.
% tke_dom = ncread(archivos{i},'TKE_PBL'); % TKE.
% lh = ncread(archivos{i},'LH'); % Calor latente.
% sh = ncread(archivos{i},'HFX'); % Calor sensible.
tsk = ncread(archivos{i},'TSK'); % Temperatura del suelo.
% sst = ncread(archivos{i},'SST'); % SST [K].
% uast = ncread(archivos{i},'UST'); % Velocidad de fricciÃn.
% el_pbl = ncread(archivos{i},'EL_PBL'); % Longitud capa limite (usado como proxy para turbulencia de macroscala).
%% Campos secundarios:
u = 0.5*(u_dom(1:end-1,:,:,:) + u_dom(2:end,:,:,:));
v = 0.5*(v_dom(:,1:end-1,:,:) + v_dom(:,2:end,:,:));
w = 0.5*(w_dom(:,:,1:end-1,:) + w_dom(:,:,2:end,:));
%tke = 0.5*(tke_dom(:,:,1:end-1,:) + tke_dom(:,:,2:end,:));
geop = ph_dom + phb_dom; % geopotencial.
h_geop = geop/9.81;
h_geop = 0.5*(h_geop(:,:,1:end-1,:) + h_geop(:,:,2:end,:)); % altura geopotencial.
t_pot = t_dom + 300; % temperatura potencial.
p = 0.01*(p_dom + pb_dom); % presión.
%prec = rainc + rainnc; % precipitaciÃn total.
temp = t_pot.*(1000./p).^(-287/1004); % temperatura [K].
%esat = 6.112*exp((17.67*(temp-273.15))./((temp-273.15) + 243.5)); % presiÃn parcial de vapor saturado (no se guarda).
%qsat = (0.622*esat)./(p-esat); % Tasa de vapor de agua saturado (no se guarda).
%hr = 100*qvapor./qsat; % Humedad relativa.
%tempv = temp.*(1 + (0.6077.*qvapor)); % Temperatura virtual (no se guarda).
%rho = p./(287.*tempv); % Densidad del aire (no se guarda).
%agua = ((qcloud(:,:,1:end-1,:) + qcloud(:,:,2:end,:))/2).*((rho(:,:,1:end-1,:) + rho(:,:,2:end,:))/2).*...
%(h_geop(:,:,2:end,:) - h_geop(:,:,1:end-1,:)); % Contenido de agua líquida [kg/m2].
%t_pot_liq = t_pot - ((2260000/1004).*qcloud); % Temperatura potencial agua líquida.
%[base, tope, grosor] = rod_wrfalturanube(qcloud,h_geop); % Altura de base, tope y grosor de nube.
%% Arreglo dimensional:
u = u(poslon,poslat,1:zlev,:);
v = v(poslon,poslat,1:zlev,:);
w = w(poslon,poslat,1:zlev,:);
p = p(poslon,poslat,1:zlev,:);
h_geop = h_geop(poslon,poslat,1:zlev,:);
t_pot = t_pot(poslon,poslat,1:zlev,:);
t2 = t2(poslon,poslat,:);
u10 = u10(poslon,poslat,:);
v10 = v10(poslon,poslat,:);
psfc = psfc(poslon,poslat,:);
lat_dom = lat_dom(poslon,poslat,:);
lon_dom = lon_dom(poslon,poslat,:);
topo_dom = topo_dom(poslon,poslat,:);
temp = temp(poslon,poslat,1:zlev,:);
tsk = tsk(poslon,poslat,:);
%% Guarda variables:
s.u = cat(4,s.u,single(u));
s.v = cat(4,s.v,single(v));
s.w = cat(4,s.w,single(w));
s.p = cat(4,s.p,single(p));
s.hg = cat(4,s.hg,single(h_geop));
s.tp = cat(4,s.tp,single(t_pot));
%s.qc = cat(4,s.qc,single(qcloud));
%s.qr = cat(4,s.qr,single(qrain));
%s.q2 = cat(3,s.q2,single(q2));
s.t2 = cat(3,s.t2,single(t2));
s.u10 = cat(3,s.u10,single(u10));
s.v10 = cat(3,s.v10,single(v10));
s.psfc = cat(3,s.psfc,single(psfc));
s.lat= cat(3,s.lat,single(lat_dom));
s.lon = cat(3,s.lon,single(lon_dom));
%s.pre = cat(3,s.pre,single(prec));
%s.qv = cat(4,s.qv,single(qvapor));
s.topo = cat(3,s.topo,single(topo_dom));
%s.tke = cat(4,s.tke,single(tke));
s.temp = cat(4,s.temp,single(temp));
%s.hr = cat(4,s.hr,single(hr));
%s.agua = cat(4,s.agua,single(agua));
%s.tp_liq = cat(4,s.tp_liq,single(t_pot_liq));
%s.el_pbl = cat(4,s.el_pbl,single(el_pbl));
%s.alt_base = cat(3,s.alt_base,single(base));
%s.alt_tope = cat(3,s.alt_tope,single(tope));
%s.grosor = cat(3,s.grosor,single(grosor));
%s.lh = cat(3,s.lh,single(lh));
%s.sh = cat(3,s.sh,single(sh));
s.tsk = cat(3,s.tsk,single(tsk));
%s.sst = cat(3,s.sst,single(sst));
%s.uast = cat(3,s.uast,single(uast));
end