Sfp 104 nl

[ToonVanDaele]

Description

Add existing protocol sfp-104-nl. Imported from existing docx

Related Issue

Task list

Steps by contributor:

• Add description to this pull request (under "## Description")
• Submit the pull request by clicking 'create pull request'
• Mark the pull request as draft
• Check whether the version number in the index.Rmd yaml section is of format yyyy.nn.dev
• In case of a protocol created from a pre-existing docx protocol, check if all sections comply with current template for a new protocol
• Add further commits if needed and push them to GitHub
• Update the protocol-specific NEWS.Rmd
• Mark the pull request as 'ready for review'

Review steps for the author(s):

• Add reviewers, at least one subject-matter specialist and one administrator
• Wait for review comments and address them
• Iterate until reviewer approvals (merging the pull request will be done by an administrator)

To be done by an administrator after review: see guidelines for admins.

[hansvancalster]

Er zijn een aantal bestanden die verwijderd moeten worden:

• 08_afhankelijkheden_(indien van toepassing).Rmd
• 10_bijlage_1
• 12_bijlage_2

Kan je ook 12_appendices.Rmd controleren? De inhoud van de bijlagen ontbreekt denk ik.

[hansvancalster]

Om van de referenties in 11_referenties.Rmd een automatisch gegenereerde referentielijst te maken, kan je werken met markdown syntax om naar documenten te refereren die in een bibliografiebestand staan (zie https://inbo.github.io/tutorials/tutorials/r_citations_markdown/).
Hier is wat er daarvoor moet gebeuren:

• een bestand referenties.yaml of referenties.bib toevoegen (afhankelijk van exportmogelijkheden van je referentiemanager - indien zotero, graag .yaml kiezen). Indien je met zotero werkt, mag dit initieel een leeg bestand zijn waarna je via de visual mode in RStudio connectie maakt met zotero en de betreffende documenten invoert (laat iets weten als dit onduidelijk is, dan leg ik dat wel eens live uit - zie ook tutorial on citation in R Markdown needs clarification tutorials#311)
• in index.Rmd in de yaml sectie bibliography: referenties.yaml toevoegen
• overige Rmd bestanden checken op verwijzingen en deze vervangen door markdown syntax @bibkey
• in 11_referenties.Rmd alles verwijderen behalve de titel en een lijn toevoegen met <div id="refs"></div>

Dit zal ook voor je andere PRs nodig zijn.

[hansvancalster]

@ToonVanDaele kan je de laatste wijzigingen eens binnenhalen en je protocol renderen: protocolhelper::render_protocol("sfp-104-nl"). Ga er dan nog eens grondig door om de laatste punten en komma's aan te pakken. De meeste kruisverwijzingen heb ik al opgelost, maar voor de verwijzingen naar paragrafen was het mij niet direct duidelijk welke paragraaf juist bedoeld wordt aangezien de nummering veranderd is. Dus zoek zeker op '§'. Zie https://bookdown.org/yihui/bookdown/cross-references.html voor uitleg hoe je hiernaar moet verwijzen. Daarna is het klaar wat mij betreft.

[ToonVanDaele]

• § paragrafen nakijken
• depencies toevoegen met add_depencies (komt in de yaml) (eerst alledrie publiceren)